高温杀菌锅底部为贮水箱，当物料装入杀菌篮并关好锅门。循环泵把水箱中的杀菌水经过过滤器后抽出，并送到换热器中用蒸汽进行加热。

从位于杀菌篮顶部的喷水管均匀地喷淋在所需杀菌的物料上面。由于循环量大，高温杀菌锅内温度非常均匀。

PLC根据测得的杀菌水温度自动打开或关闭蒸汽阀门。

通过计算出在此温度下锅内所需的压力，自动控制进、排气阀的开关，使整个高温杀菌锅杀菌过程中锅内的压力与温度成一定的关系。当高温杀菌锅处于加热和保温状态时，蒸汽阀门和疏水阀自动打开，冷却水阀门自动关闭；当高温杀菌锅处于冷却状态时，蒸汽阀门和疏水阀自动关闭，冷却水进、出阀门自动打开。

杀菌结束后，高温杀菌锅循环泵停止，循环水重新回到锅底储水箱以备下次循环使用。